De bossen van Schoonbeek liggen op schrale, zure zandgronden met daartussen nattere, moerassige stukken. Vroeger werden vooral naaldbomen aangeplant; meer dan 60% is bezet met grove den. Er zijn ook enkele bosbestanden met Corsicaanse den, lariks, fijnspar of andere naaldbomen. Amerikaanse eik werd ook veel geplant, maar samen met de Amerikaanse vogelkers wordt deze ongewenste woekersoort (exoot) nu bestreden. Van nature komen loofboomsoorten voor zoals zomereik, berk, zwarte els, lijsterbes, sporkehout ...
Enkele poelen en vennen herbergen watergebonden fauna en flora. Er komen ook vele soorten bosvogels en typische zoogdieren (ree, vos, eekhoorn, steenmarter ...) voor.