De Centrale Diensten van het ANB bestaan uit drie afdelingen die op hun beurt weer onderverdeeld zijn in aparte cellen. Iedere cel heeft specifieke taken en wordt geleid door een celverantwoordelijke. Het OC is geen aparte afdeling van het ANB maar heeft een apart statuut als ondersteunend centrum. Zowel bij de Centrale Diensten als bij de Provinciale Diensten is er een belangrijke opdeling in drie thematische afdelingen: beleid, beheer en natuurinspectie.