De wettelijke basis voor de wetgeving inzake soortenbescherming in Vlaanderen ligt vervat in een reeks nationale en internationale wetteksten.
België heeft een aantal internationale verdragen ondertekend en zich zo geëngageerd om inspanningen te doen voor het behoud van de biodiversiteit. België is evenwel een federale staat, waarbij een hele reeks bevoegdheden zijn toegewezen aan de gewesten. Dit is onder meer het geval voor natuurbehoud. Wat het Vlaamse Gewest betreft is met andere woorden de Vlaamse overheid de bevoegde instantie. De belangrijkste verdragen die betrekking hebben op het soortenbeleid staan hieronder opgesomd.
Op het niveau van de Europese Unie is de soortenbescherming uitgebouwd rond twee belangrijke richtlijnen:
Op het Vlaamse niveau is de regelgeving inzake soortenbescherming geregeld in het soortenbesluit. Dit soortenbesluit vervangt sinds 1 september 2009 de Koninklijke besluiten van 16 februari 1976 (planten), 22 september 1980 (diersoorten uitgezonderd vogels) en 9 september 1981 (vogels).
Onder het betreffende Koninklijk besluit kan je de informatie vinden voor afwijkingen op deze soortenbeschermingswetgeving aan te vragen.